Prokaryot olduklarından zarla çevrili çekirdek , mitokondri , kloroplast , endoplazmik retikulum , golgi gibi organelleri yoktur . Ribozom bütün bakterilerin temel organelidir . DNA , RNA , canlı hücre zarı ve sitoplazma yine bütün bakterilerin temel yapısını oluşturur .
Bunlara ek olarak bütün bakterilerde hücre , cansız bir çeperle ( murein ) sarılıdır . Çeperin yapısı , bitki hücrelerinin çeperinden farklıdır . Selüloz ihtiva etmez . Bazı bakterilerde hücre çeperinin dışında kapsül bulunur . Kapsül bakterinin dirençliliğini ve hastalık yapabilme ( patojen olma ) özelliğini artırır .