Mantarların insan yaşamında hem olumsuz hem de olumlu etkileri bulunmaktadır. İnsanlarda el ve ayaklarda kaşıntıya neden olan hastalık yapıcı türleri olduğu gibi, tahıllarda ve asmalarda (üzüm bitkisi) zarara yol açan çeşitleri de vardır. Bitkilere bulaşan bu mantarlar tarımsal ilaçlarla yok edilmeye çalışılır. Ayrıca ormanlık alanlarda bulunan şapkalı mantarların birçoğu zehirli olabileceğinden besin olarak tüketilmesi tehlikelidir.
Öte yandan mantarların yararları da bulunmaktadır. Örneğin peynir küfünden "penisilin" adı verilen bir tür ilaç yapılmaktadır. Ayrıca insanlar tarafından bahçelerde yetiştirilen kültür mantarları zehirli değildir ve besin maddesi olarak kullanılabilir.