Bilinen adıyla J. J. Thomson, İngiliz fizikçidir. Elektronu, izotopları ve kütle spektrometresini keşfetmiştir.
Joseph John Thomson, 1856 yılında Cheetham Hill, Manchester'da İskoç bir aileden dünyaya gelmiştir. Owens Kolejinde mühendislik eğitimi almaya başladıktan sonra Trinity Koleji, Cambridge'e geçmiştir. 1880 yılında matematik derecelerini almış, 1884 yılında Cavendish'te fizik profesörlüğü unvanını kazanmıştır.
1890 yılında Sir George Edward Paget'nin kızı Rose Elisabeth Paget ile evlenmiş; George Page Thomson adında bir oğlu ve Joan Page Thomson adında bir kızı olmuştur. Oğlu da elektronun dalga benzeri özelliklerini keşfederek Nobel Ödülü alan ünlü bir fizikçi olmuştur. Öğrencilerinden biri Ernest Rutherford'dur.
Thomson, 1906 yılında elektronu bulduğu için Nobel Fizik Ödülü'nü almıştır. 1908'de şövalye unvanı almış, 1912'de Order of Merit'e davet edilmiş ve 1914'te Oxford Üniversitesi'nde "atom kuramı" üzerine bir ders vermiştir. 1940 yılında vefat etmiş ve Westminster Abbey'de Isaac Newton'a yakın bir yere gömülmüştür.