Çerkez Ethem kuvvetlerinin amacı, Milli Mücadele döneminde vatan savunmasında kendi birliğiyle görev yapmak ve bağımsız hareket etmektir. Türkiye Büyük Millet Meclisi'nin (TBMM) kurulmasından sonra düzenli ordunun içinde yer almak istememiş, kendi kuvvetlerinin bağımsız kalmasını sağlamayı amaçlamıştır.
Bu amaç doğrultusunda çeşitli sebeplerle TBMM hükümeti ile anlaşmazlıklar yaşamış, özellikle düzenli ordunun kurulmasına karşı çıkmış ve kuvvetlerine "Umumi Kuva-yi Seyyare" adını vererek bağımsız bir komutanlık talep etmiştir. Ayrıca TBMM'nin asker toplama yetkisini, yargılamalar için kurduğu İstiklal Mahkemelerini ve Batı Cephesi'nin komuta yapısındaki değişiklikleri tanımamıştır.
Sonuç olarak Çerkez Ethem kuvvetlerinin amacı, TBMM'den bağımsız olarak kendi örgütlenmesiyle milli mücadele yürütmek ve düzenli orduya katılmadan kendi komutası altında savunma yapmak olmuştur.