Mariana Çukuru, Büyük Okyanus'un batısında ve Mariana Adaları'nın doğusunda bulunmaktadır. En derin kesimi olan Challenger Deep'in matematiksel konumu yaklaşık olarak 11°22′ kuzey enlemi ile 142°36′ doğu boylamıdır. Ölçüm yöntemlerine göre bu koordinatlarda küçük farklılıklar olabilir.