Akşemseddin, Osmanlı döneminde önemli bir bilim insanı, hekim ve filozof olarak tanınır. Mikrop teorisinin öncülerinden biri olarak kabul edilir. Akşemseddin'in en bilinen katkısı, hastalıkların mikrop adı verilen küçük canlılar tarafından yayıldığını savunmasıdır. Bu görüşü ile hastalıkların bulaşmasını önlemek için temizlik ve hijyen kurallarına önem verilmesi gerektiğini belirtmiştir.
Akşemseddin ayrıca medikal bitkilerin kullanımı konusunda da çalışmalarda bulunmuş ve hastalıklarla mücadelede doğal ilaçların önemini vurgulamıştır.