Galatasaray Lisesi'nin kökeni, Osmanlı döneminde Enderun'daki görevlilerin eğitiminin verildiği Galata Sarayı Ocağı'na dayanmaktadır. Kurumun tarihiyle ilgili öne çıkan aşamalar şunlardır:
- Kuruluş: II. Bayezid döneminde Gül Baba'nın isteğiyle bir mektep ve darülşifa yaptırılmış; II. Bayezid, babası Fatih Sultan Mehmed'in idealindeki okulu Galata Sarayı Ocağı adıyla kurmuştur.
- Tarihsel Süreç: 1675 yılında tasfiye edilen kurum, 1715'te yeniden açılmış; 1820 yılından sonra Tıbbiye ve Askeri Kışla olarak kullanılmıştır.
- Mekteb-i Sultani Dönemi: Batılılaşma döneminde aydın kadrolar yetiştirmek amacıyla 1 Eylül 1868'de Abdülaziz'in katıldığı törenle Mekteb-i Sultani adıyla yeniden faaliyete geçmiştir.
- Cumhuriyet Dönemi: 1927 yılında Galatasaray Lisesi adını alarak Cumhuriyet devrimlerine uygun eğitime başlamış, genel kültür dersleri Türkçe verilmeye başlanmıştır. 1975'te Anadolu Lisesi statüsüne getirilmiş, 1994 yılında ise Galatasaray Üniversitesi'ne dönüşen sürecin temelleri atılmıştır.