Thomson atom modelini inceleyen Rutherford,bir dizi deneyler yapmış ve Thomson atom modelinin deneye uymadığını görünce Thomson atom modeline karşı kendi atom modelini ortaya koymuştur.Kısaca Rutherford'un atom modeline göre atomlar pozitif yüklü bir çekirdek ve bu çekirdeğin pozitif yükünü nötrleştirecek sayıda çekirdeğin etrafını çeviren negatif yüklü elektronlardan oluşuyordur.Çekirdek boyut itibariyle atoma göre küçük olmasına rağmen atomun kütlesinin tamamı çekirdekte bulunuyordur!