Bakterilerin beslenme şekilleri farklı gruplara ayrılır. Genel olarak üç ana beslenme şekli vardır:
- Ototrof bakteriler: Kendi besinlerini üretirler. Genellikle fotosentez veya kemosentez yaparak inorganik maddelerden organik besinler oluştururlar.
- Heterotrof bakteriler: Organik maddeleri hazır besin olarak kullanırlar. Canlı veya ölü organik maddeleri parçalayıp enerji elde ederler.
- Parazit bakteriler: Başka canlıların üzerinde ya da içinde yaşamlarını sürdürür ve onlardan besin temin ederler.
Bakterilerin bu farklı beslenme şekilleri, yaşadıkları ortamın koşullarına göre değişiklik gösterir ve ekolojik dengeyi sağlar.