Zübeyde Hanım, 1857 yılında Selanik'te doğdu. Orta Anadolu'dan göç ederek Selanik'in batısında Arnavutluk sınırına yerleştirilen yörüklerden, Hacı Sofi ailesinden Feyzullah Ağa'nın kızıdır. Selanik’te Gümrük Muhafaza Teşkilatında memur olan Ali Rıza Efendi ile evlenmiştir.
Ali Rıza Efendi ile evliliğinden beş çocuk sahibi olan Zübeyde Hanım; Fatma, Ömer ve Naciye'yi küçük yaşlarda kaybetmiştir. 1888 yılında Mustafa ilkokuldayken kocasını kaybetmiş, zaman zaman çocukları ile birlikte kardeşi Hüseyin Ağa’nın çiftliğine gitmiştir. Bu sırada Atatürk’ün ifadesiyle iyi kalpli bir insan olan Ragıp Bey’le evlenmiştir.
Balkan harbinden sonra kızı Makbule ile birlikte Selanik’ten göç ederek İstanbul’a gelmiş ve Beşiktaş-Akaretler’de bir eve yerleşmiştir. Millî Mücadele yıllarında Ankara’ya gelen Zübeyde Hanım, 1919'da ayrılmak zorunda kaldığı oğlunu yıllar sonra Ankara’da Devlet Başkanı olarak görmüştür.
Zübeyde Hanım, 14 Ocak 1923’te tedavi amacıyla gittiği İzmir’de 66 yaşında vefat etmiştir.