Bu soru, kendi besinlerini üretebilen ve ekosistemlerin temel üreticilerinden olan ototrof bakterilerin biyolojik ve metabolik özelliklerini araştırmaktadır. Ototrof bakteriler, yaşamlarını sürdürmek için gerekli organik bileşikleri dışarıdan almak yerine, inorganik maddelerden sentezlerler. Bu süreç genellikle iki ana yolla gerçekleşir: güneş ışığını enerji kaynağı olarak kullanan fotosentez (örneğin siyanobakteriler) veya inorganik kimyasal reaksiyonlardan enerji sağlayan kemosentez (örneğin nitrifikasyon bakterileri). Açıklamanızda, bu bakterilerin karbon kaynağı (genellikle CO2) ve enerji kaynağı